Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFKBIAP25963 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms