Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRBP23467 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRBP23467 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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