Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKACBP22694 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms