Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCP2P22307 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCP2P22307 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCP2P22307 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCP2P22307 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCP2P22307 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCP2P22307 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCP2P22307 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2P22307 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2P22307 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCP2P22307 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCP2P22307 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCP2P22307 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCP2P22307 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCP2P22307 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCP2P22307 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCP2P22307 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCP2P22307 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCP2P22307 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCP2P22307 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCP2P22307 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCP2P22307 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCP2P22307 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCP2P22307 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2P22307 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2P22307 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms