Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB4AP20338 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4AP20338 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms