Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A1P19634 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms