Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTLA4P16410 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms