Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRF1P14222 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRF1P14222 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRF1P14222 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRF1P14222 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRF1P14222 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRF1P14222 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms