Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HLA-EP13747 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-EP13747 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms