Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOP2AP11388 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms