Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HKR1P10072 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HKR1P10072 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HKR1P10072 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HKR1P10072 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HKR1P10072 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HKR1P10072 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HKR1P10072 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HKR1P10072 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HKR1P10072 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HKR1P10072 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HKR1P10072 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HKR1P10072 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HKR1P10072 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms