Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALM1P0DP23 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALM1P0DP23 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALM1P0DP23 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CALM1P0DP23 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALM1P0DP23 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALM1P0DP23 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALM1P0DP23 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALM1P0DP23 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALM1P0DP23 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CALM1P0DP23 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CALM1P0DP23 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALM1P0DP23 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALM1P0DP23 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms