Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
RGPD2P0DJD1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD2P0DJD1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms