Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACAA1P09110 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms