Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PKHD1P08F94 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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