Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP3P08254 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP3P08254 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP3P08254 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP3P08254 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP3P08254 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP3P08254 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP3P08254 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP3P08254 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP3P08254 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP3P08254 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP3P08254 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP3P08254 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP3P08254 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP3P08254 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP3P08254 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP3P08254 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP3P08254 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP3P08254 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP3P08254 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP3P08254 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP3P08254 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP3P08254 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP3P08254 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP3P08254 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP3P08254 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP3P08254 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP3P08254 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP3P08254 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP3P08254 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP3P08254 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP3P08254 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP3P08254 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP3P08254 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP3P08254 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms