Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPM2P07951 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPM2P07951 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM2P07951 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms