Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTSLP07711 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CTSLP07711 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CTSLP07711 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTSLP07711 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTSLP07711 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTSLP07711 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTSLP07711 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms