Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASS1P00966 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASS1P00966 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASS1P00966 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASS1P00966 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASS1P00966 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASS1P00966 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASS1P00966 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASS1P00966 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASS1P00966 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASS1P00966 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASS1P00966 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASS1P00966 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ASS1P00966 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASS1P00966 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ASS1P00966 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASS1P00966 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASS1P00966 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASS1P00966 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASS1P00966 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASS1P00966 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASS1P00966 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASS1P00966 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASS1P00966 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASS1P00966 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASS1P00966 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASS1P00966 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ASS1P00966 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ASS1P00966 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ASS1P00966 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASS1P00966 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ASS1P00966 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ASS1P00966 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASS1P00966 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASS1P00966 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASS1P00966 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ASS1P00966 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASS1P00966 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ASS1P00966 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ASS1P00966 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASS1P00966 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ASS1P00966 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASS1P00966 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASS1P00966 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ASS1P00966 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASS1P00966 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASS1P00966 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASS1P00966 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASS1P00966 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASS1P00966 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASS1P00966 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASS1P00966 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ASS1P00966 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ASS1P00966 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASS1P00966 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASS1P00966 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASS1P00966 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASS1P00966 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASS1P00966 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASS1P00966 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASS1P00966 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASS1P00966 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASS1P00966 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms