Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EGFRP00533 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EGFRP00533 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EGFRP00533 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EGFRP00533 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EGFRP00533 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EGFRP00533 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EGFRP00533 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EGFRP00533 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EGFRP00533 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EGFRP00533 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EGFRP00533 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EGFRP00533 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EGFRP00533 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EGFRP00533 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EGFRP00533 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EGFRP00533 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EGFRP00533 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EGFRP00533 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EGFRP00533 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EGFRP00533 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EGFRP00533 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EGFRP00533 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EGFRP00533 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EGFRP00533 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EGFRP00533 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EGFRP00533 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EGFRP00533 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EGFRP00533 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EGFRP00533 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms