Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNTO95613 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNTO95613 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNTO95613 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNTO95613 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNTO95613 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNTO95613 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNTO95613 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNTO95613 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNTO95613 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCNTO95613 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCNTO95613 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCNTO95613 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCNTO95613 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCNTO95613 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PCNTO95613 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNTO95613 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNTO95613 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNTO95613 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNTO95613 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNTO95613 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNTO95613 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNTO95613 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNTO95613 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNTO95613 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNTO95613 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNTO95613 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNTO95613 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNTO95613 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNTO95613 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNTO95613 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNTO95613 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNTO95613 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNTO95613 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNTO95613 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNTO95613 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNTO95613 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNTO95613 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNTO95613 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNTO95613 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNTO95613 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNTO95613 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNTO95613 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNTO95613 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNTO95613 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNTO95613 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNTO95613 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNTO95613 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNTO95613 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNTO95613 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNTO95613 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNTO95613 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNTO95613 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNTO95613 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNTO95613 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNTO95613 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNTO95613 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNTO95613 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNTO95613 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms