Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECM2O94769 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ECM2O94769 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
ECM2O94769 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM2O94769 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM2O94769 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM2O94769 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM2O94769 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM2O94769 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM2O94769 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM2O94769 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM2O94769 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM2O94769 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM2O94769 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM2O94769 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECM2O94769 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM2O94769 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM2O94769 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM2O94769 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms