Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
VAMP4O75379 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP4O75379 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms