Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms