Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP3O75154 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms