Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA3O75145 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms