Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP9AO75110 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9AO75110 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms