Protein–RNA interactions for Protein: O60683

PEX10, Peroxisome biogenesis factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX10O60683 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PEX10O60683 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX10O60683 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX10O60683 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX10O60683 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX10O60683 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX10O60683 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX10O60683 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX10O60683 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX10O60683 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX10O60683 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX10O60683 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX10O60683 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX10O60683 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX10O60683 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX10O60683 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX10O60683 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX10O60683 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms