Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms