Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKAB2O43741 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms