Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP2AO43633 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms