Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYT7O43581 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYT7O43581 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYT7O43581 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYT7O43581 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms