Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms