Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
MAP3K13O43283 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP3K13O43283 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms