Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MSH5O43196 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MSH5O43196 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MSH5O43196 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSH5O43196 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSH5O43196 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSH5O43196 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSH5O43196 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MSH5O43196 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSH5O43196 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSH5O43196 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSH5O43196 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSH5O43196 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSH5O43196 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSH5O43196 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSH5O43196 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSH5O43196 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSH5O43196 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSH5O43196 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSH5O43196 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSH5O43196 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSH5O43196 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSH5O43196 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSH5O43196 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSH5O43196 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSH5O43196 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSH5O43196 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSH5O43196 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MSH5O43196 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSH5O43196 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSH5O43196 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MSH5O43196 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSH5O43196 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSH5O43196 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSH5O43196 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSH5O43196 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSH5O43196 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSH5O43196 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSH5O43196 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSH5O43196 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSH5O43196 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSH5O43196 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSH5O43196 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSH5O43196 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSH5O43196 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MSH5O43196 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSH5O43196 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSH5O43196 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSH5O43196 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSH5O43196 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MSH5O43196 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
MSH5O43196 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MSH5O43196 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MSH5O43196 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MSH5O43196 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 506.4 ms