Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM6AO15550 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms