Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN2DO15399 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIN2DO15399 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms