Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC27A2O14975 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A2O14975 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms