Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKBKBO14920 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKBO14920 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms