Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF6O14896 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF6O14896 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF6O14896 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF6O14896 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF6O14896 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF6O14896 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF6O14896 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF6O14896 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF6O14896 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF6O14896 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF6O14896 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF6O14896 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF6O14896 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF6O14896 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF6O14896 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF6O14896 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF6O14896 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF6O14896 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF6O14896 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF6O14896 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF6O14896 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF6O14896 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF6O14896 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF6O14896 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF6O14896 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF6O14896 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF6O14896 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF6O14896 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF6O14896 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF6O14896 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF6O14896 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF6O14896 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF6O14896 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF6O14896 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF6O14896 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF6O14896 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF6O14896 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF6O14896 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF6O14896 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF6O14896 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF6O14896 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF6O14896 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF6O14896 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF6O14896 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms