Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHOX2AO14813 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms