Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVH48-1M5A8F1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms