Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms