Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms