Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM223BA6NKX1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms