Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PSDA5PKW4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms