Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCE3A1L190 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms