Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POTEB3A0JP26 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms