Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAV27A0A087WT01 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms