Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MIR6831-201ENST00000617240 81 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AP001469.1-202ENST00000626933 695 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ZNF182-201ENST00000376943 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 PSG8-204ENST00000406636 1610 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 KIAA0040-201ENST00000423313 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CORIN-205ENST00000504584 2417 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CAST-244ENST00000515663 1473 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LINC01725-205ENST00000457273 1991 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 DNAI1-201ENST00000242317 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AMELY-201ENST00000215479 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL109615.1-201ENST00000331979 455 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AZI2-202ENST00000334100 943 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RPS12P16-201ENST00000399739 407 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 FAM218BP-201ENST00000408897 458 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RN7SKP251-201ENST00000410830 314 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 RBBP4P2-201ENST00000478252 1264 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LINC01095-203ENST00000512063 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 STMN2-203ENST00000518491 585 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ACTBP6-201ENST00000520036 1090 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AP001372.1-202ENST00000533008 344 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LINC00678-202ENST00000534757 798 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 PCED1B-AS1-209ENST00000552269 673 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 EIF4EBP1P1-201ENST00000557776 341 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MIR3125-201ENST00000579927 78 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MIR3150B-201ENST00000580142 86 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LINC01483-205ENST00000591334 620 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 Metazoa_SRP.101-201ENST00000611704 303 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 PGM5P3-AS1-206ENST00000621255 877 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 Metazoa_SRP.108-201ENST00000621610 300 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 LINC01206-231ENST00000629026 858 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AL157371.2-201ENST00000637813 480 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MIR3160-2-201ENST00000637870 81 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 TRPS1-208ENST00000519076 3329 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 CCDC77-203ENST00000422000 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 GMFB-209ENST00000616146 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NBR1Q14596 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms